浸沒式膜生物反應器由膜的使用狀況不同分為內置式和外置式兩種。內置式是將膜直接浸漬于生化反應池中，直接從膜元件中抽出凈水，而外置式則是用泵將生物反應池的水通過膜組件進行錯流過濾循環，得到潔凈的透過水。目前投入運營的膜生物反應器大多數是內置式的。
引起浸沒式膜生物反應器中膜污染的主要因素包括:
(1)無機鹽的沉積當原水中鹽的濃度超過其溶度積，就會在膜表面或膜孔徑內形成沉淀或結垢。這主要是指水中的鈣、鎂、鐵等離子形成的碳酸鹽、硫酸鹽或氫氧化物的沉淀在膜表面的沉積。由于膜生物反應器并不直接產生鹽濃縮現象，其無機鹽污染較輕。
(2)微生物的附著由于浸沒式膜生物反應器中的微生物活性和數量*，從系統的運行開始就極易發生膜的微生物污染。隨著附著在膜表面微生物的生長殖，形成生物膜，老化生物膜分解的蛋白質、核酸、多糖脂和其他大分子物質，將會引起表面的改性，從而更容易吸附其他微生物。因此，微生物在膜表面的附著是造成污染的最主要因素。
(3)懸浮物截留主要是指進水中的懸浮物、微粒和膠體在膜表面和膜孔徑內的截留，尤其是蛋白質等大分子在膜表面和膜孔內的吸附，從而造成膜孔變小或堵塞。
技術在處理生活污水中有著很多的優點，當我們把這項技術運用在生活污水處理中的時候，它能很好的實現固液分離，從而達到很好的處理效果，使出水水質很好。當我們在使用一項新的技術時，我們經常做的事情就是與過去的技術相互比較，于是可以得到，突出優點有：
(1)當生活污水中有很多的固體廢棄物的時候，使用技術，可以很好的分離固體廢棄物，對固體廢棄物處理效果良好，而且很能很好的把固體和液體分離，達到我們滿意的處理結果；
(2)在使用的時候，這項技術比較容易讓人上手，關鍵是操作起來沒有那么困難，另外還能很好的控制水力停留時間；
(3)在整個操作過程當中，還有利于保護微生物，使微生物不會那么容易流失，而且還能控制污泥濃度；
(4)由于浸沒式膜生物反應器中，運用到了生物技術，所以在使用這項技術的時候，可以使某些細菌得到增殖，從而能夠更好的使污水達到理想的處理效果，這不僅提高了一些細菌的數量，還使得更多的有機物得到了充分的分解；
(5)在使用的時候，會使最終處理的廢水中污泥的含量低于預想的結果，大大降低了污泥處理的費用；
(6)使用平板膜的過程中，會產生一定的作用力，而這項作用力可以使污泥絮體的體積有一定的減小，由于該平板膜的快速運動，使污泥的傳氧速度大大提高。
